46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2470 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  100 
 
 
362 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  77.41 
 
 
371 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  71.35 
 
 
363 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  70.22 
 
 
357 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  70.22 
 
 
357 aa  528  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  70.22 
 
 
357 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  67.23 
 
 
360 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  65.19 
 
 
372 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  56.76 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  56.79 
 
 
377 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  57.58 
 
 
353 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  50.13 
 
 
390 aa  353  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  48.66 
 
 
387 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  47.54 
 
 
396 aa  325  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  39.07 
 
 
384 aa  236  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  32 
 
 
354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  30.57 
 
 
387 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  29.97 
 
 
340 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  30.81 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  31.1 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  29.87 
 
 
362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  26.08 
 
 
368 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  30.25 
 
 
386 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  28.9 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  31.64 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  29.51 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  30.67 
 
 
339 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  28.33 
 
 
319 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  28.74 
 
 
327 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  27.78 
 
 
386 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  27.67 
 
 
386 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  27.2 
 
 
393 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  34.71 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  27.38 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3212  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  24.79 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  25.65 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  29.58 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  26.13 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  32.97 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  34.03 
 
 
470 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  25 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
295 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  34.38 
 
 
182 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  33.02 
 
 
129 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>