More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0252 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  58.33 
 
 
300 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  55.27 
 
 
296 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 
308 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  44.23 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  43.28 
 
 
300 aa  188  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
296 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  34.15 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 
315 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 
275 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
286 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  30.6 
 
 
292 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
290 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
296 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  29.5 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  30.38 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
261 aa  96.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  30.5 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
271 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  31.44 
 
 
267 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
267 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
292 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  30.12 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  32.56 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  30.57 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  32.81 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  32.81 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  31.92 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  31.92 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  31.92 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  32.94 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  33.07 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  33.07 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  33.07 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  33.07 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  31.54 
 
 
281 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
290 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  32.08 
 
 
280 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
292 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
289 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  29.76 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  30.53 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  30.53 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  28.69 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  29.37 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  29.37 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  24.82 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  30.66 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
267 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  29.43 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  31.14 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  25.66 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  29.71 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  25.99 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  33.93 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  29.69 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  27.94 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  25.1 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  23.59 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.94 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.3 
 
 
390 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
260 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  40.59 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.88 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  31.67 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  27.24 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  33.06 
 
 
286 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 
288 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>