127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2106 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 292 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  94.52 
 
 		 292 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  86.62 
 
 		 289 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  85.96 
 
 		 289 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  85.56 
 
 		 289 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  29.1 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  27.84 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  27.84 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  27.8 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  28.06 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  28.03 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  27.69 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  27.13 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  28.12 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  28.68 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  26.92 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  27.41 
 
 		 270 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  24.26 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  25.93 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  26.3 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  25.64 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  26.64 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  25.93 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  25.64 
 
 		 281 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  25.64 
 
 		 281 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  25.56 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  25.27 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  23.42 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  26.87 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  26.87 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  26.87 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  26.87 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  26.87 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  26.87 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  26.87 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  26.37 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  26.02 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  25.4 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  24.31 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  28.1 
 
 		 418 aa  72.4  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  26.64 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  23.66 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  25.7 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  22.05 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  22.99 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  23.46 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.46 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5224  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164951  normal  0.667008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  24.23 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.23 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5487  hypothetical protein  34.51 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324647  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  24.32 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  47.92 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.67 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  27.81 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  24.88 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>