100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3404 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  98.28 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  89.93 
 
 		 294 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  85.17 
 
 		 290 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  67.36 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  65.62 
 
 		 292 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  63.89 
 
 		 292 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  54.83 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  27.55 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  27.55 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  26.81 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  26.45 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 261 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  24.62 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  25.47 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  26.38 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  24.72 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  25.95 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  24.81 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  25.4 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  25.48 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  25.64 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  26.69 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  25.98 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  25.73 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  26.37 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  24.63 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  24.76 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  25.24 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  24.76 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  25.24 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  25.24 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  25.24 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  24.76 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  24.76 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  28.64 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  25.87 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  23.56 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  26.02 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  26.42 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  23.56 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  25.25 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  26.73 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  25 
 
 		 444 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  26.21 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 		 315 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.25 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  18.63 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  23.81 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  21.4 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.45 
 
 		 351 aa  42.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 		 299 aa  42  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>