91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0787 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  100 
 
 
296 aa  619  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  97.3 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  61.46 
 
 
293 aa  353  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  30.66 
 
 
287 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  29.74 
 
 
262 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  29.97 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  31.62 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  29.74 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  30.15 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  27.94 
 
 
270 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  28.47 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  30.18 
 
 
275 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  30.18 
 
 
275 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  30.18 
 
 
275 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  27.78 
 
 
270 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  30.18 
 
 
275 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  30.18 
 
 
275 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  30.18 
 
 
275 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  30.18 
 
 
275 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  30.18 
 
 
275 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  28.25 
 
 
269 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  28 
 
 
267 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  29.82 
 
 
309 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
268 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  29.45 
 
 
281 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
267 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  28.73 
 
 
281 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  29.09 
 
 
281 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  28.73 
 
 
281 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  28.73 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  29.09 
 
 
281 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  28.04 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  31.27 
 
 
270 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  29.63 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
289 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
273 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
286 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
289 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
292 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
289 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
290 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  29.43 
 
 
269 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
292 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
273 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
290 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  27.14 
 
 
273 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
290 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  26.95 
 
 
273 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.64 
 
 
292 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  27.61 
 
 
289 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  25.9 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  28.67 
 
 
280 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
279 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  24.65 
 
 
299 aa  59.7  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  24.57 
 
 
418 aa  59.3  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  24.88 
 
 
444 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  24.57 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  23.15 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.05 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.55 
 
 
562 aa  42.4  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  34.04 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>