110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2563 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
267 aa  547  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  96.63 
 
 
267 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  83.77 
 
 
275 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  84.79 
 
 
275 aa  460  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  83.77 
 
 
275 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  83.02 
 
 
275 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  83.02 
 
 
275 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  83.02 
 
 
275 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  83.4 
 
 
275 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  83.02 
 
 
275 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  85.23 
 
 
264 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  80.68 
 
 
281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  81.06 
 
 
281 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  81.06 
 
 
281 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  79.55 
 
 
281 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  79.92 
 
 
281 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  80.3 
 
 
281 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  79.47 
 
 
309 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  59.55 
 
 
268 aa  346  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  57.03 
 
 
273 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  57.03 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  54.41 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  55.89 
 
 
273 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  49.63 
 
 
280 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  47.89 
 
 
289 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  48.12 
 
 
270 aa  240  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  49.42 
 
 
283 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  49.41 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  49.8 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  48.47 
 
 
269 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  46.04 
 
 
286 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  36.92 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  36.54 
 
 
261 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  40.38 
 
 
287 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  40 
 
 
287 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  39.23 
 
 
262 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  40.38 
 
 
262 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  38.08 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  39.08 
 
 
269 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 
267 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  37.69 
 
 
270 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  38.08 
 
 
269 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
268 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
279 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  31.76 
 
 
267 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  29.32 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  28.21 
 
 
296 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  27.84 
 
 
296 aa  122  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  27.47 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
308 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
289 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
289 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  25.46 
 
 
292 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  25.18 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
285 aa  72  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 
290 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 
290 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  23.56 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  27.62 
 
 
444 aa  58.9  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  23.31 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 
299 aa  58.9  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  25.3 
 
 
418 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  21.84 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  24.07 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  48 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  35.05 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
239 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
260 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  31.07 
 
 
303 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  37.5 
 
 
2839 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  37.5 
 
 
2832 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.87 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  37.5 
 
 
2839 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  37.5 
 
 
2835 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  37.5 
 
 
2832 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>