136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3339 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  86.87 
 
 		 283 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  70 
 
 		 270 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  68.86 
 
 		 269 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  62.11 
 
 		 271 aa  354  8.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  62.11 
 
 		 271 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  58.54 
 
 		 286 aa  348  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  61.72 
 
 		 275 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  50.37 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  49.27 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  48.91 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  48.91 
 
 		 281 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  48.91 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  48.51 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  48.91 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  47.6 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  47.6 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  48.54 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  48.13 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  48.54 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  47.76 
 
 		 275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  47.76 
 
 		 275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  47.76 
 
 		 275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  47.76 
 
 		 275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  47.45 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  46.72 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  46.24 
 
 		 273 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  45.49 
 
 		 273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  44.36 
 
 		 273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  46.35 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  42.28 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  42.55 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  32.71 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  32.71 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  36.15 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  34.09 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  33.96 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  35.38 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  34.34 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  33.71 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  34.47 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  33.58 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  32.13 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  30.19 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  27.78 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  27.43 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  29.23 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.71 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  21.9 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  21.25 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.3 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  25.82 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  22.02 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  24.02 
 
 		 444 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 302 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 302 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  30.53 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  29.09 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.82 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  31.03 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  29.01 
 
 		 362 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.02 
 
 		 456 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  32.76 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 302 aa  45.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  28.69 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>