101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2844 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  558  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  52.59 
 
 
270 aa  291  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  57.43 
 
 
271 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  57.43 
 
 
271 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  58.23 
 
 
275 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  53.05 
 
 
269 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  53.61 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  52.73 
 
 
283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  50.37 
 
 
289 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  49.09 
 
 
275 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  49.09 
 
 
275 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  52.36 
 
 
268 aa  254  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  50.91 
 
 
273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  48.91 
 
 
275 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  52.87 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  50.77 
 
 
275 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  48.54 
 
 
275 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  52.11 
 
 
281 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  48.54 
 
 
275 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  48.54 
 
 
275 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  48.54 
 
 
275 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  49.63 
 
 
267 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  52.11 
 
 
281 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  51.72 
 
 
281 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  49.63 
 
 
273 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  49.63 
 
 
267 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  51.72 
 
 
281 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  50.39 
 
 
273 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  50.56 
 
 
281 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  49.82 
 
 
281 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  50 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  50.19 
 
 
264 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  36.05 
 
 
261 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  36.05 
 
 
261 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
279 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  39.33 
 
 
270 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  38.91 
 
 
270 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  39.45 
 
 
269 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
268 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  36.4 
 
 
287 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  36.4 
 
 
287 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  37.4 
 
 
262 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  38.65 
 
 
269 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  37.4 
 
 
262 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  33.72 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
261 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  33.85 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  28.52 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  28.67 
 
 
296 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  29.03 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  30.37 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  30.27 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
290 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  31.18 
 
 
444 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
315 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  24.63 
 
 
320 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
300 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  54.17 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2642  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
296 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  33.83 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  22.97 
 
 
304 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  48.78 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  34.21 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
312 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>