99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2020 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  99.64 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  93.95 
 
 		 281 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  94.31 
 
 		 281 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  94.66 
 
 		 281 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  93.95 
 
 		 281 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  91.14 
 
 		 309 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  86.62 
 
 		 275 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  86.25 
 
 		 275 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  86.25 
 
 		 275 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  86.25 
 
 		 275 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  86.25 
 
 		 275 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  85.87 
 
 		 275 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  85.5 
 
 		 275 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  85.87 
 
 		 275 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  80.3 
 
 		 267 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  81.06 
 
 		 267 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  80.3 
 
 		 264 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  60.61 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  57.04 
 
 		 273 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  56.83 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  55.93 
 
 		 273 aa  315  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  54.55 
 
 		 273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  51.35 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  53.63 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  49.43 
 
 		 289 aa  248  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  49.82 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  47.58 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 271 aa  241  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  49.6 
 
 		 271 aa  241  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  48.47 
 
 		 269 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  46.79 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  35.36 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  35.36 
 
 		 261 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  39.08 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  39.08 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  38.31 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  38.7 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  38.7 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  38.91 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  38.31 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  38.08 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  30.62 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  30.15 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  29.79 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  28.85 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  29.45 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.3 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.7 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  26.52 
 
 		 444 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 317 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  28.57 
 
 		 418 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  21.8 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.07 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.88 
 
 		 456 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  42 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  30.82 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  34.04 
 
 		 249 aa  42.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  34.74 
 
 		 299 aa  42  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>