More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1152 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
239 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  45.58 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
279 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  30.71 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 
258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
262 aa  105  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
245 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 
280 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 
265 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
239 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.76 
 
 
289 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  30.57 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.75 
 
 
283 aa  95.1  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.28 
 
 
425 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.62 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
265 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
263 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.17 
 
 
266 aa  92  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
264 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.34 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.83 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  28.63 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  28.41 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  28.45 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  25.52 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
314 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.96 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  32.07 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  30 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  29.57 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  28.74 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28.69 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
253 aa  72  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  27.75 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  27.17 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  31.63 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.78 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  26.02 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  31.96 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.63 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.1 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  27.5 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  27.83 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>