56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  100 
 
 		 243 aa  477  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  44.66 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  43.05 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  36.76 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  34.42 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  31.12 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  34 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  28.11 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  29.44 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  27.83 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  31.82 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  32.84 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  31.84 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  32.41 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  31.09 
 
 		 263 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  27.07 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  26.96 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  43.08 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  50 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  48 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  54.17 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33438  predicted protein  30.64 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.163153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  48 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  43.14 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  46 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  48 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  41.51 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  42 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  43.1 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  43.1 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  43.1 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  43.86 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  50.98 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  42 
 
 		 281 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  42 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  50.98 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 		 329 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  52.94 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 		 273 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  54.55 
 
 		 308 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>