25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1301 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  484  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  48.98 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  44.94 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  48 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  41.11 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  43.98 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  44.73 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  44.44 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  44.33 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  42.92 
 
 		 284 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  45.68 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  44.63 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  44.21 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  36.79 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  34.8 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  32.24 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  36.76 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  34.17 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.09 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  35.79 
 
 		 324 aa  45.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  30.32 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  39.34 
 
 		 286 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>