35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1705 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  70.97 
 
 		 282 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  65.18 
 
 		 265 aa  342  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  57.31 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  52.23 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  53.97 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  52.3 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  51.68 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  45.54 
 
 		 264 aa  188  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  44.17 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  45.1 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  45.08 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  42.13 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  42.23 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  33.67 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  36.27 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  29.21 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  29.25 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  28.43 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  27.07 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.74 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  27.8 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  27.32 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  27.37 
 
 		 361 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0275  Alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 414 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  36.92 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  28.8 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  27.75 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 369 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  28.8 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  55.26 
 
 		 364 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>