47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2778 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  47.4 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  37.76 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  33.67 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  38.38 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  36.87 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  33.5 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  36.41 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  34.31 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  35.96 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  33.19 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  34.35 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  38.31 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  34.69 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  32.44 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  36.56 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  30.81 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  28.24 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  29.33 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  32.46 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  29.21 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  36.13 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  30 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  31.82 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.09 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  27.59 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  29.78 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  25.58 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  26.76 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0893  esterase, putative  26.92 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  28.03 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  28.18 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0871  hypothetical protein  26.92 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  28.12 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  21.84 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  25.85 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  43.64 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  27.19 
 
 		 342 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  43.64 
 
 		 326 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.82 
 
 		 430 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>