85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1910 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  100 
 
 		 338 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  93.2 
 
 		 338 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  71.6 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  49.07 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  48.53 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  39.06 
 
 		 302 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  38.34 
 
 		 430 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  39.93 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  40.5 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  37.92 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  38.96 
 
 		 303 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  38.53 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  37.29 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  31.62 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  34.58 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  34.21 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  30.35 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  32.28 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  27.23 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  31.86 
 
 		 246 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  31.5 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  29.52 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  29.76 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.66 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  24.49 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  29.94 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  28.42 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  30.66 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  26.53 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  24.26 
 
 		 195 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  24.26 
 
 		 195 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  25.52 
 
 		 194 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  26.26 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  25.39 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  28.57 
 
 		 206 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  26.04 
 
 		 192 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 		 475 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  29.21 
 
 		 269 aa  52.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  26.29 
 
 		 216 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  34.75 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  29.81 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  33.02 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  33.02 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  28.86 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  22.68 
 
 		 203 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  28.57 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.95 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  28.3 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  31.05 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 		 457 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  33.72 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  27.5 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  24.32 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  36.49 
 
 		 683 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  29.46 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  29.25 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  29.21 
 
 		 524 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  29.7 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  29.57 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  23.73 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  23.22 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  56.52 
 
 		 589 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  25.91 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1460 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  30.7 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  23.62 
 
 		 197 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  27.75 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  32.46 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  32.46 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  32.46 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  32.46 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  23.32 
 
 		 222 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  28.49 
 
 		 265 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  30.39 
 
 		 211 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1768  putative lipase transmembrane protein  31.82 
 
 		 237 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  48.94 
 
 		 743 aa  42.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 277 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0043  alpha/beta hydrolase fold  52.63 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  28.8 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>