84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0349 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  544  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  35.29 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  32 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  32.54 
 
 
259 aa  92.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  36.15 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  32.24 
 
 
254 aa  88.6  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  30.92 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  32.69 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  32.08 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  33.49 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  29.21 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  28.11 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  31.75 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  28.77 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  31.03 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  30.62 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  28.85 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  28.1 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  29.33 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  37.38 
 
 
364 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
365 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  38.89 
 
 
364 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  37.96 
 
 
364 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  37.96 
 
 
364 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  37.96 
 
 
364 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  37.96 
 
 
364 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  37.96 
 
 
364 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  32.09 
 
 
377 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  34.58 
 
 
364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  34.58 
 
 
360 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  34.58 
 
 
360 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  34.58 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  34.29 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  34.29 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  33.64 
 
 
364 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  33.05 
 
 
367 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  33.05 
 
 
367 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  33.33 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  33.05 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  33.05 
 
 
367 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  33.05 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  33.05 
 
 
367 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  33.05 
 
 
367 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  34.38 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  23.27 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2927  hypothetical protein  33.33 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.423308 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  25.17 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  30 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  24.05 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1667  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  35.78 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  34.62 
 
 
339 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  33.71 
 
 
309 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  51.11 
 
 
351 aa  42.7  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  29.77 
 
 
309 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  33.33 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  32.08 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  32.08 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  34.58 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 
234 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
281 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
310 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  59.38 
 
 
232 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  56.76 
 
 
364 aa  42.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
305 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
323 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
296 aa  42  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
284 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
296 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>