40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3646 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  87.69 
 
 		 262 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  79.05 
 
 		 263 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  75 
 
 		 262 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  52.7 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  55.65 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  52.3 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  47.46 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  43.68 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  47.44 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  45.28 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  47.53 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  45.68 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  41.8 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  33.19 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  35.11 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  33.5 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  34.23 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  31.3 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  32.41 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0275  Alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 414 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  27.92 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33438  predicted protein  32.41 
 
 		 365 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.163153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  27.41 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  28.8 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  31.41 
 
 		 361 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  27.18 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  38 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  24.39 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  24.07 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  26.64 
 
 		 393 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  26.67 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  57.58 
 
 		 271 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  57.58 
 
 		 271 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  57.58 
 
 		 271 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>