80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0272 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  86.57 
 
 
216 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  44.6 
 
 
255 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  44.39 
 
 
221 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  43.66 
 
 
309 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  43.66 
 
 
221 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  44.29 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  43.26 
 
 
229 aa  171  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  43.46 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  43.26 
 
 
211 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  43.93 
 
 
241 aa  163  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  41.31 
 
 
268 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  38.5 
 
 
255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  34.1 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  37.38 
 
 
393 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  31.63 
 
 
207 aa  121  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  35.51 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  29.05 
 
 
247 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.7 
 
 
254 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.7 
 
 
254 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  34.16 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  26.58 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  31.02 
 
 
393 aa  82  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  26.7 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  31.08 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  31.19 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  25.69 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  27.19 
 
 
222 aa  61.6  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  26.42 
 
 
204 aa  61.6  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  25.94 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  23.94 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  28.3 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  27.44 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  30 
 
 
284 aa  52.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  27.57 
 
 
210 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  28.3 
 
 
294 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.91 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  29.46 
 
 
282 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  34.29 
 
 
285 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  29.63 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.32 
 
 
276 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
302 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
349 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  26.73 
 
 
683 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
296 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
296 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
296 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
296 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 
296 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
311 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
311 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  36.89 
 
 
1878 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  28.3 
 
 
324 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  31.25 
 
 
432 aa  45.1  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  30.34 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  30 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  37.04 
 
 
2169 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  33.02 
 
 
361 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  34.12 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  32.46 
 
 
430 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  26.76 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  28.97 
 
 
265 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.48 
 
 
298 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  26.49 
 
 
415 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  30.08 
 
 
332 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  30.08 
 
 
332 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  25.22 
 
 
313 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  27.54 
 
 
303 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  26.87 
 
 
166 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1128  hypothetical protein  24.79 
 
 
303 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1101  hypothetical protein  24.79 
 
 
303 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  31.53 
 
 
299 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  27.82 
 
 
362 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  22.7 
 
 
382 aa  42  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  40.74 
 
 
364 aa  41.6  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
303 aa  41.6  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
296 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  27.54 
 
 
303 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>