17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0947 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  100 
 
 
683 aa  1380    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  39.77 
 
 
313 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  36.63 
 
 
589 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  39 
 
 
356 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  46.15 
 
 
393 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  37.33 
 
 
338 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  32.99 
 
 
360 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  32.99 
 
 
360 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  32.99 
 
 
341 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  26.73 
 
 
216 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  32.99 
 
 
364 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  36.49 
 
 
338 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  30.84 
 
 
285 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  38.89 
 
 
298 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  41.18 
 
 
191 aa  45.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  32.26 
 
 
364 aa  45.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  34.21 
 
 
432 aa  43.9  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>