85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2353 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  100 
 
 		 382 aa  777    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  26.02 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  34.78 
 
 		 191 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  24.43 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  25.4 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  26.63 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  26.16 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  32.2 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  33.04 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  33.06 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  29.41 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  30.28 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.5 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  31.62 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  26.71 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  29.91 
 
 		 221 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  22.83 
 
 		 299 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  33.9 
 
 		 324 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  28.57 
 
 		 294 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  32.97 
 
 		 474 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  31.52 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  28.83 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  29.13 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  28.36 
 
 		 195 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  27.93 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  22.15 
 
 		 339 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  26.61 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.81 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  30.88 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  23.33 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  24.79 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  28.93 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  27.82 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  25.9 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  27.61 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  23.11 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  27.27 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  22.15 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  27.27 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  27.27 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0873  PGAP1 family protein  27.66 
 
 		 1257 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.730318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  23.84 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  27.08 
 
 		 561 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  31 
 
 		 488 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0751  hypothetical protein  23.43 
 
 		 492 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.870291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0450  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  25.21 
 
 		 275 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  30 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  26.43 
 
 		 192 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0628  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.19 
 
 		 270 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  26.61 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  25.84 
 
 		 255 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  26.15 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  30.85 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  27.12 
 
 		 304 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  29.57 
 
 		 344 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  26.36 
 
 		 236 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  22.75 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  25.17 
 
 		 2169 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  27.91 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  25.43 
 
 		 222 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  28.07 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  29.55 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  23.73 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  25.4 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  26.71 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.21 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  26.45 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  30.77 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  26.8 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  26.63 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0189  PGAP1 family protein  32.77 
 
 		 784 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  23.53 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  31.4 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  26.03 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  24.66 
 
 		 254 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  27.03 
 
 		 249 aa  43.5  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  30 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1868  hypothetical protein  46.51 
 
 		 312 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.602901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  30.77 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  22.97 
 
 		 293 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  25.62 
 
 		 203 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 265 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 365 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  28.92 
 
 		 633 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  43.18 
 
 		 312 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>