69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0697 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  100 
 
 
282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  36.23 
 
 
285 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  40.08 
 
 
334 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  38.1 
 
 
361 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  35.83 
 
 
284 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  42.25 
 
 
286 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.39 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.12 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  30.64 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  30.95 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  32.18 
 
 
304 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  26.35 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  30.54 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  27.36 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  27.36 
 
 
303 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  36.97 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  29.94 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  29.9 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  28.69 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  31.25 
 
 
332 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  30.21 
 
 
430 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  24.87 
 
 
362 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  32.73 
 
 
339 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  25.73 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  31.07 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  29.46 
 
 
216 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  37.5 
 
 
589 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  29.77 
 
 
533 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.147109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  28.1 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
945 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.33 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  28.19 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.17 
 
 
293 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  27.78 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  28.95 
 
 
216 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  29.15 
 
 
249 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  42.86 
 
 
743 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  28.33 
 
 
332 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  25.83 
 
 
205 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  28.06 
 
 
211 aa  45.8  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  35.71 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  25.41 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  33.09 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  26.32 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  27.64 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  29.23 
 
 
533 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  28.23 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  28.33 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  23.66 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  31.93 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  30.84 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  41.82 
 
 
189 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  30 
 
 
377 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2184  hypothetical protein  29.23 
 
 
533 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  29.01 
 
 
533 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2300  hypothetical protein  29.23 
 
 
533 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.140059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2158  hypothetical protein  28.24 
 
 
533 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  31.67 
 
 
222 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  27.92 
 
 
1381 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  32.73 
 
 
211 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  43.64 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  26.05 
 
 
342 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2153  hypothetical protein  29.23 
 
 
533 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2003  hypothetical protein  29.23 
 
 
533 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  24.77 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  30.65 
 
 
459 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  31.08 
 
 
378 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  27.62 
 
 
280 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>