24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2528 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  918    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  58.82 
 
 
457 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  28.44 
 
 
2159 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  23.66 
 
 
876 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  23.66 
 
 
876 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  29.11 
 
 
1805 aa  57.4  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  27.91 
 
 
1460 aa  56.6  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  27.24 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  23.04 
 
 
1878 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  43.75 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  21.57 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  30.93 
 
 
449 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  30.09 
 
 
589 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1868  hypothetical protein  26.89 
 
 
312 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.602901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  28.71 
 
 
312 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  27.12 
 
 
1937 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  31.58 
 
 
407 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  48.98 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.8 
 
 
276 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  45.45 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_72879  predicted protein  36 
 
 
967 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  45.45 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2143  hydrolase/lipase  38.24 
 
 
336 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  41.3 
 
 
396 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>