35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3479 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  100 
 
 		 378 aa  734    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  41.85 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  38.93 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  44.05 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  44.05 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  39.27 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  38.1 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  35.56 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  37.46 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  37.14 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  35.69 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  33.54 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  35.69 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  35.45 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  31.39 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  28.48 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  29.75 
 
 		 487 aa  112  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  29.49 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  28.98 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  35.46 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  24.79 
 
 		 382 aa  49.7  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1333  hypothetical protein  26.83 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  34.31 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  35.07 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  33.33 
 
 		 334 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  28.3 
 
 		 285 aa  46.2  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.7 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  46 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  48.98 
 
 		 459 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  32.37 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  23.83 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  40 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1912  hypothetical protein  26.02 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2388  lipase  33.33 
 
 		 643 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  35.2 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>