45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4244 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  100 
 
 		 327 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  43.61 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  42.76 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  40.5 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  42.5 
 
 		 303 aa  192  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  42.5 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  41.08 
 
 		 430 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  41.45 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  41.1 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  40.5 
 
 		 338 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  41.98 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  34.19 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  37.69 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  33.85 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  34.85 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  33.93 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  34.12 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  32.17 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  33.33 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  24.8 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  28.19 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.29 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  30.93 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  26.44 
 
 		 206 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  29.59 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  31.07 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  32.98 
 
 		 269 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.12 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  27.4 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  34.19 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28.44 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  24.53 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  30.72 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  23.79 
 
 		 222 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  27.91 
 
 		 382 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  23.94 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25 
 
 		 195 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  27.27 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  26.59 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  27.51 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  32 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25 
 
 		 195 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  28.02 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  24 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>