113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1358 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  100 
 
 
286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  48.32 
 
 
361 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  47.77 
 
 
334 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  43.98 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  42.25 
 
 
282 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  38.66 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  32.45 
 
 
294 aa  99  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  35.16 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  30.35 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  31.02 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  30.59 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  31.17 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  35.03 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  32.4 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  27.8 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  30.09 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  33.33 
 
 
430 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  34.84 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  31.84 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  26.64 
 
 
344 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  33.16 
 
 
327 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  28.07 
 
 
200 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  36.96 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  28.07 
 
 
200 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  34.65 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  36.69 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  36.69 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  24.06 
 
 
195 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  24.06 
 
 
195 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.71 
 
 
217 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  33.33 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  39.45 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  29 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  23.64 
 
 
197 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  29 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  24.22 
 
 
222 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  24.11 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  24.1 
 
 
203 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  25.39 
 
 
211 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  24.53 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  27.27 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  29.76 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  30.83 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  36.29 
 
 
414 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  41.33 
 
 
743 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  26.32 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  24.12 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  21.69 
 
 
197 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0628  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  32.48 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  30.77 
 
 
205 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  31.75 
 
 
222 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  32.74 
 
 
249 aa  49.3  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  37.01 
 
 
418 aa  49.3  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  36.29 
 
 
399 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  31.62 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  29.68 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  24.57 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  33.59 
 
 
166 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  31.33 
 
 
356 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.95 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  35.07 
 
 
378 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 
276 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  26.48 
 
 
286 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  28.99 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  36.76 
 
 
474 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  31.62 
 
 
220 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  29.29 
 
 
362 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  33.03 
 
 
254 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  30.11 
 
 
191 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  29.59 
 
 
413 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  29.59 
 
 
413 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  37.18 
 
 
488 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  50 
 
 
286 aa  45.8  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  33.06 
 
 
399 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  35.9 
 
 
487 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  26.32 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  43.75 
 
 
589 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0134  PGAP1 family protein  34.17 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.535724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  30.08 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  31.51 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  29.17 
 
 
393 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  35.71 
 
 
772 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  37.33 
 
 
332 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  26.23 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  20.83 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  29.82 
 
 
209 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  31.36 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  31.87 
 
 
192 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  28.41 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  27.52 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  39.44 
 
 
231 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
260 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  32.97 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>