112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3296 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  100 
 
 
269 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  41.18 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  39.04 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  36.2 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  32.16 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  27.65 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  31.37 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  31.56 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.67 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  28 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  31.42 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  31.79 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  32 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  30 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  30.77 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  30.89 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  31.86 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  30.91 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  31.86 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  30.7 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  35.32 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  28.86 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  35.05 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  31.72 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  28.9 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  31.4 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  34.66 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  32.05 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  23.72 
 
 
203 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  26.7 
 
 
206 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  35.19 
 
 
299 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  32.37 
 
 
311 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  31.5 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  22.82 
 
 
203 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  33.58 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  26.03 
 
 
197 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  32.02 
 
 
195 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  29.29 
 
 
304 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  29.76 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  30.49 
 
 
191 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  25.91 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  32.11 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.29 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  31.05 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  32.02 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  30.9 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  25.99 
 
 
200 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  25.99 
 
 
200 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  34.95 
 
 
191 aa  52.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  28.5 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25 
 
 
195 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  30.99 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
377 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  28.05 
 
 
192 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.31 
 
 
334 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  28.93 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  23.11 
 
 
382 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  36.25 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  32.98 
 
 
327 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  35.29 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.67 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  29.93 
 
 
573 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  29.63 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  48.05 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  30.63 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  28.99 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  27.59 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  32.23 
 
 
231 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  35.59 
 
 
356 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.56 
 
 
430 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  28.57 
 
 
304 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  21.98 
 
 
191 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1213  putative lipase  29.57 
 
 
237 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.137275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  26.43 
 
 
450 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  34.51 
 
 
377 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  31.21 
 
 
303 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.82 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  39.6 
 
 
284 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  27.88 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3518  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  38.78 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  31.15 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  31.15 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04171  hypothetical protein  26.47 
 
 
197 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0117581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  27.91 
 
 
332 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  31.15 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  24.44 
 
 
533 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  26.95 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  28.82 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  30.7 
 
 
364 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2927  hypothetical protein  31.88 
 
 
422 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.423308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  30.7 
 
 
364 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  21.18 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  40.3 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  30.7 
 
 
364 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  29.63 
 
 
361 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.53 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>