118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0709 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  100 
 
 
302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  55.43 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  52.85 
 
 
282 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  51.19 
 
 
286 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  48.99 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  47.06 
 
 
303 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  43 
 
 
314 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  47.68 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  48.58 
 
 
282 aa  212  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  50.41 
 
 
286 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  46.07 
 
 
281 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  45.78 
 
 
289 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  45.78 
 
 
573 aa  175  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  38.41 
 
 
304 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  43.68 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  33.1 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  35.34 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  31.99 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  35.34 
 
 
276 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  33.73 
 
 
281 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  34.44 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  35.03 
 
 
225 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  34.43 
 
 
222 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  34.65 
 
 
217 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  32.24 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  33.33 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  30.24 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  30.53 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  31.02 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  26.91 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  25.96 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  28.31 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  28.31 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  31.4 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  30.3 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  27.62 
 
 
216 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  29.8 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  29.8 
 
 
287 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  26.88 
 
 
206 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  25.4 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  33.08 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  29.41 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  36.08 
 
 
364 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  39.56 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.08 
 
 
430 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  36.08 
 
 
341 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  36.08 
 
 
360 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  36.08 
 
 
360 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  33.08 
 
 
2169 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  36.08 
 
 
364 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.83 
 
 
286 aa  55.8  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  36.96 
 
 
364 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  36.08 
 
 
364 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  35.87 
 
 
367 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  35.87 
 
 
367 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  35.87 
 
 
367 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  35.87 
 
 
367 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  26.19 
 
 
191 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  35.87 
 
 
364 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  35.87 
 
 
367 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  35.87 
 
 
367 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  35.87 
 
 
367 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  22.95 
 
 
276 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  36.08 
 
 
364 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  35.87 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  35.87 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  35.87 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  29.57 
 
 
203 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.01 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  34.78 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
365 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  32.99 
 
 
332 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  38.46 
 
 
318 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  24.9 
 
 
450 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  48.9  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  34.78 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  25.85 
 
 
211 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  32.26 
 
 
357 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  26.7 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  30.97 
 
 
194 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  31.96 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  24.87 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  26.82 
 
 
275 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  28.57 
 
 
197 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1057  lipase, class 2  23.81 
 
 
235 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.24448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  27.23 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  26.67 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  23.63 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  27.23 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  23.63 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.17 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.17 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  34.07 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  28.02 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>