33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1154 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  50.96 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  48.3 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  45.95 
 
 		 302 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  48.48 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  46.4 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  46.32 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  46.77 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  44.8 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  41.73 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  40.46 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  44 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  47.2 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  44.35 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  38.93 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  33.7 
 
 		 573 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  35.76 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  38.21 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  35.4 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  31.03 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  37.61 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  33.06 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  34.55 
 
 		 294 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  36.11 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  34.21 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  34.21 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  32.11 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  31.53 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  30.47 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  40.82 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>