98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5938 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  100 
 
 
283 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  63.45 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  53.23 
 
 
311 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  50 
 
 
282 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  48.29 
 
 
302 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  51.21 
 
 
280 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  51.19 
 
 
282 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  45.45 
 
 
286 aa  218  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  41.31 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  48.96 
 
 
286 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  44.96 
 
 
281 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  42.7 
 
 
289 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  36.86 
 
 
304 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  41.23 
 
 
573 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  35.14 
 
 
283 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  34.89 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  38.46 
 
 
307 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  46.32 
 
 
257 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  36.05 
 
 
281 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  36.08 
 
 
222 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  39.13 
 
 
276 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  35.82 
 
 
225 aa  99  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  31.62 
 
 
222 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  32.63 
 
 
222 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  32.98 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  31.5 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  33.33 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  34.07 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  27.17 
 
 
195 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  27.17 
 
 
195 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  30.16 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  26.78 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  26.37 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  28.38 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  30.28 
 
 
191 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  34.58 
 
 
2169 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  30.05 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  35.78 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  37.37 
 
 
364 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  25.53 
 
 
294 aa  52.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  37.37 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  37.37 
 
 
360 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  37.37 
 
 
360 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  37.37 
 
 
364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  24.47 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  27.17 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  35.35 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  35.35 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  30.41 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  35.35 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  35.35 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  35.35 
 
 
367 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  35.35 
 
 
367 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13201  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.62 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  37 
 
 
367 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  29.41 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  35.35 
 
 
367 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  28.99 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  38.2 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
365 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  23.71 
 
 
206 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  37.36 
 
 
309 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  30.2 
 
 
364 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  23.68 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  23.68 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  35.58 
 
 
364 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  30.87 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  30.3 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  27.03 
 
 
303 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  35.58 
 
 
364 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  35.58 
 
 
364 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  28.82 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  31.76 
 
 
364 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  31.25 
 
 
191 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  25.71 
 
 
194 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  27.03 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  24.6 
 
 
211 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
323 aa  45.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  23.45 
 
 
338 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  29.21 
 
 
450 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  30.77 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0661  hypothetical protein  28.81 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
377 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  32.46 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  20 
 
 
197 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  31.67 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  31.09 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37370  predicted protein  30 
 
 
314 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.273183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  29.17 
 
 
353 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25 
 
 
314 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  29.17 
 
 
324 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>