58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4818 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  100 
 
 
303 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  63.45 
 
 
283 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  51.37 
 
 
311 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  45.99 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  47.59 
 
 
282 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  44.92 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  44.64 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  45.53 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  44.77 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  40.5 
 
 
289 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  41.87 
 
 
281 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  41.77 
 
 
573 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  38.78 
 
 
314 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  37.4 
 
 
304 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 
280 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  36.33 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  42.53 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  32.35 
 
 
293 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  44 
 
 
257 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  33 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  34.76 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  35.29 
 
 
281 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  31.41 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  29.02 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  28.65 
 
 
222 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  28.65 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  33.85 
 
 
223 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  25.64 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  30.92 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  30.57 
 
 
299 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25.6 
 
 
195 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25.6 
 
 
195 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  29.76 
 
 
309 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  35.54 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  40 
 
 
364 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  40 
 
 
341 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  30.07 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  40 
 
 
360 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  32.04 
 
 
356 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  27.55 
 
 
450 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  40 
 
 
360 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  34.48 
 
 
367 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  34.48 
 
 
367 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  34.48 
 
 
367 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  34.48 
 
 
367 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  33.57 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  26.97 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  30.83 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  34.48 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  34.48 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  34.48 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  29.65 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  65.52 
 
 
365 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  65.52 
 
 
364 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  32.86 
 
 
287 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  25 
 
 
206 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  23.08 
 
 
2169 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  27.48 
 
 
191 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>