45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1028 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  71.05 
 
 		 195 aa  277  6e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  64.25 
 
 		 206 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  53.48 
 
 		 191 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  47.09 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  47.09 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  42.86 
 
 		 197 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  38.62 
 
 		 203 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  38.1 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  36.51 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  31.05 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  31.05 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  29.32 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  30.69 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  30.53 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  28.95 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  30.11 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  28.8 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  32.28 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  31.58 
 
 		 281 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  31.76 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  24.5 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  25.5 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  30.28 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  28.78 
 
 		 313 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  27.17 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  34.95 
 
 		 269 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  27.52 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  25.17 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  31.78 
 
 		 276 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  28.69 
 
 		 282 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  29.5 
 
 		 356 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  28.16 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  24.49 
 
 		 286 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  27.66 
 
 		 280 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  24.24 
 
 		 302 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.06 
 
 		 275 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  27.48 
 
 		 303 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  27.56 
 
 		 289 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  23.46 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  39.53 
 
 		 342 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  27.61 
 
 		 314 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  27.68 
 
 		 311 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.89 
 
 		 430 aa  41.2  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  28.68 
 
 		 357 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>