73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3323 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  100 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  59.26 
 
 		 192 aa  238  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  59.89 
 
 		 194 aa  235  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  58.38 
 
 		 191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  35.48 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  35.98 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  37.34 
 
 		 195 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  37.34 
 
 		 195 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  33.51 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  31.05 
 
 		 197 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  30 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  29.47 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  27.42 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.67 
 
 		 298 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  34.42 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  34.42 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  32.28 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  30.54 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  30.48 
 
 		 313 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  32.35 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  26.22 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  26.88 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  30.97 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  33.12 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.47 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.28 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  26.74 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  27.38 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  29.69 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  29.41 
 
 		 287 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  24.6 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  28.68 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  22.86 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  28.68 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  33.58 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  29.41 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  26.42 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  26.42 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  21.47 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.18 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  27.37 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  25.95 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  25.39 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  24.56 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  26.2 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  26.63 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  26.79 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  30.28 
 
 		 468 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  25.39 
 
 		 276 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  22.97 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  32.43 
 
 		 357 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  24.53 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  26 
 
 		 302 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  28.06 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  23.5 
 
 		 280 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.19 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  25.54 
 
 		 361 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.46 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  24.6 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  28.06 
 
 		 282 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  22.9 
 
 		 281 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  22.4 
 
 		 282 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  28.05 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  24.87 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  24.72 
 
 		 286 aa  45.1  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  40.26 
 
 		 387 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.71 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  22.93 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45579  predicted protein  27.57 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  25.76 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  39.02 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1247  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  42  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  29.09 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>