113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0648 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  100 
 
 		 356 aa  694    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  61.65 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  46.04 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  34.95 
 
 		 276 aa  90.5  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  30.43 
 
 		 211 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  32.93 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  31.37 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  30.29 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  32.17 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  28.71 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  33.62 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  30.41 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.48 
 
 		 217 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  33.5 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  33.5 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  28 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  31.71 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  32.73 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  27.55 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  25.47 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  31.85 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  32.46 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  31.85 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  32.51 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  25.71 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  26.43 
 
 		 203 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  29.67 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  26.67 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  31.36 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  25.4 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.95 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  30.66 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  28.57 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  31.12 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  32.47 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  29.2 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  30.81 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  29.44 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  31.12 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  23.31 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.93 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  28.93 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  30.19 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  30.23 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  29.57 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  28.49 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  27.94 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  30.66 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  29.67 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  37.5 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  23.61 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  27.94 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  28.85 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  31.33 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  31.25 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  29.32 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  26.49 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  26.49 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  25.6 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  27.45 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  29.5 
 
 		 191 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  28.83 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  26.71 
 
 		 191 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  39 
 
 		 683 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  28.18 
 
 		 283 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  25.17 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  29.41 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  29.31 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  28.24 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  27.23 
 
 		 289 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  27.86 
 
 		 293 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.14 
 
 		 273 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1108  hypothetical protein  27.14 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  28.11 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  33.68 
 
 		 573 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  29.09 
 
 		 280 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  30 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  24.19 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  29.93 
 
 		 195 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  35.59 
 
 		 269 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1333  hypothetical protein  30.43 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  26.02 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.2 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  27.03 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2003  hypothetical protein  47.83 
 
 		 533 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2153  hypothetical protein  47.83 
 
 		 533 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  45.65 
 
 		 533 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  34.69 
 
 		 589 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  29.82 
 
 		 309 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  32.31 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  42.11 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1213  putative lipase  31.58 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.137275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  27.12 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3706  putative lipase transmembrane protein  32.37 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.278273  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  26.36 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1995  PGAP1 family protein  28.35 
 
 		 536 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0402712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2158  hypothetical protein  45.65 
 
 		 533 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1955  hypothetical protein  45.65 
 
 		 533 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 254 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>