62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0705 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  69.47 
 
 		 194 aa  274  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  65.95 
 
 		 191 aa  268  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  59.26 
 
 		 211 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  35.68 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  35.68 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  32.12 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  34.71 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  29.63 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  33.52 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  28.57 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  27.51 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  28.49 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  28.8 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  30.27 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  30.27 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  29.65 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  32.26 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  26.2 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  27.86 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  32.05 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  26.7 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  22.7 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  27.27 
 
 		 294 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  26.9 
 
 		 303 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  26.9 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  32.06 
 
 		 313 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  30.77 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  28.49 
 
 		 332 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  26.2 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  29.49 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  28.95 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  29.49 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  26.84 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  21.81 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  43.06 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.87 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  23.44 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  26.04 
 
 		 338 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  25.39 
 
 		 304 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  26.63 
 
 		 342 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  25.17 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  25 
 
 		 339 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1108  hypothetical protein  26.7 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  27.98 
 
 		 344 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  25.52 
 
 		 338 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  21.02 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  28.05 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  26.5 
 
 		 285 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  26.43 
 
 		 382 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  20.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  31.48 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  31.82 
 
 		 468 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.67 
 
 		 293 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  27.48 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03084  lipase/serine esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12320)  27.33 
 
 		 465 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  31.87 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45579  predicted protein  29.03 
 
 		 366 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  22.83 
 
 		 286 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  29.09 
 
 		 361 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  24.22 
 
 		 276 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1937 aa  41.6  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.485173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>