64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0349 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  100 
 
 
309 aa  614  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  51.54 
 
 
302 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  52.68 
 
 
304 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  46.08 
 
 
303 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  45.73 
 
 
303 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  44.1 
 
 
430 aa  205  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  42.42 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  43.61 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  40.38 
 
 
338 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  43.36 
 
 
338 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  43.19 
 
 
339 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  38.55 
 
 
344 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  35.56 
 
 
324 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  30.8 
 
 
294 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.26 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28.57 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  31.29 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  34.84 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  32.17 
 
 
191 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  30.25 
 
 
194 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  29.69 
 
 
211 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  26.35 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  29.33 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  30.77 
 
 
203 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  25.13 
 
 
200 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  25.13 
 
 
200 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  28.47 
 
 
225 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  31.19 
 
 
197 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  25.5 
 
 
191 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  24.6 
 
 
217 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  26.2 
 
 
192 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  37.29 
 
 
361 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  29.91 
 
 
203 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  28.68 
 
 
216 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  29.46 
 
 
356 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  27.96 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  29.33 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  27.43 
 
 
191 aa  52.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  28.21 
 
 
197 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  24.72 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  30 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  29.13 
 
 
195 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  30.23 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  26.19 
 
 
211 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  27.68 
 
 
206 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  22.8 
 
 
222 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  26.63 
 
 
276 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  29.17 
 
 
269 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  22.78 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  24.06 
 
 
223 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  29.84 
 
 
206 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  30 
 
 
468 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0628  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.9 
 
 
270 aa  46.2  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  32 
 
 
743 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  37.65 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  53.49 
 
 
357 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 
263 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  26.67 
 
 
195 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.19 
 
 
448 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  26.88 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  29.7 
 
 
473 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  27.03 
 
 
275 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  24.39 
 
 
236 aa  42.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>