86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3632 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  65.95 
 
 
192 aa  268  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  63.35 
 
 
194 aa  255  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  58.38 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  33.33 
 
 
211 aa  127  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  35.68 
 
 
195 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  35.68 
 
 
195 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  35.83 
 
 
206 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  32.32 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  34.43 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  28.57 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  29.69 
 
 
203 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  33.12 
 
 
197 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  30.11 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  29.38 
 
 
200 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  29.38 
 
 
200 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  32.56 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  33.55 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  31.68 
 
 
299 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  27.66 
 
 
191 aa  84.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  29.5 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.33 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  35.11 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.19 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2847  hypothetical protein  28.72 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.804469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  28.08 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  42.55 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  29.3 
 
 
287 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  29.3 
 
 
287 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  28.57 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  27.39 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  25.26 
 
 
332 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  34.78 
 
 
382 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  27.6 
 
 
225 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  26.97 
 
 
304 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  26.04 
 
 
339 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  30.49 
 
 
269 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  27.78 
 
 
293 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  24.34 
 
 
276 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  26.53 
 
 
338 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  23.76 
 
 
303 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  25.68 
 
 
302 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.49 
 
 
334 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  23.76 
 
 
303 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  29.76 
 
 
286 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  29.03 
 
 
324 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  36.79 
 
 
281 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  26.19 
 
 
302 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  33.65 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  34.26 
 
 
276 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  27.43 
 
 
309 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  21.66 
 
 
222 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1108  hypothetical protein  26.77 
 
 
293 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  27.23 
 
 
246 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  25.79 
 
 
286 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  22.01 
 
 
222 aa  51.2  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  24.06 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.02 
 
 
430 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  25.46 
 
 
282 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  25.35 
 
 
311 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  24.24 
 
 
285 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  29.31 
 
 
282 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  23.47 
 
 
289 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  30.28 
 
 
293 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  24.87 
 
 
361 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  31.25 
 
 
283 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.08 
 
 
273 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  31.73 
 
 
249 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  33.96 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  29.01 
 
 
261 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.68 
 
 
286 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  35.8 
 
 
589 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  41.18 
 
 
683 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  24.31 
 
 
286 aa  44.7  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  27.19 
 
 
357 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  29.07 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  31.13 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1768  putative lipase transmembrane protein  26.56 
 
 
237 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  35.21 
 
 
468 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  25.26 
 
 
344 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  33.75 
 
 
246 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  38.16 
 
 
387 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  35.21 
 
 
573 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  26.96 
 
 
273 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  24.3 
 
 
229 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  29.46 
 
 
210 aa  41.2  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>