45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0929 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  100 
 
 
195 aa  393  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  71.05 
 
 
191 aa  277  6e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  60.56 
 
 
206 aa  217  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  51.34 
 
 
191 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  46.32 
 
 
200 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  46.32 
 
 
200 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  40.84 
 
 
197 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  40.31 
 
 
203 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  40.31 
 
 
203 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  38.74 
 
 
197 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  31.09 
 
 
195 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  30.57 
 
 
195 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  31.09 
 
 
216 aa  104  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  29.32 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  29.9 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  30.29 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  33.55 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  32.26 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  30.97 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.69 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  29.33 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  30.05 
 
 
276 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  32.02 
 
 
269 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  27.65 
 
 
225 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  25.95 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  30.22 
 
 
313 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  29.13 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  27.17 
 
 
283 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  25.95 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  26.99 
 
 
298 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.2 
 
 
275 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  30.56 
 
 
334 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  25 
 
 
302 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  23.96 
 
 
302 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  28.18 
 
 
299 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  26.71 
 
 
342 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  25.38 
 
 
303 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  25.38 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  22.22 
 
 
222 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  25.4 
 
 
282 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  24.78 
 
 
286 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  29.82 
 
 
442 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  24.37 
 
 
304 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  25.26 
 
 
361 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  27.93 
 
 
415 aa  41.2  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>