26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2031 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  100 
 
 
442 aa  889    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  31.6 
 
 
415 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0194  hypothetical protein  41.58 
 
 
577 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0942336  normal  0.647559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1578  PGAP1 family protein  29 
 
 
672 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3441  hypothetical protein  31 
 
 
647 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0562556  normal  0.317069 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1514  hypothetical protein  26.61 
 
 
868 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1693  hypothetical protein  26.61 
 
 
851 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2242  hypothetical protein  33 
 
 
694 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.083593  hitchhiker  0.00000521325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1086  hypothetical protein  30.1 
 
 
650 aa  56.6  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0172314  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0924  hypothetical protein  25 
 
 
674 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0877014  normal  0.706185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1313  hypothetical protein  28 
 
 
672 aa  54.3  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.520548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  29.25 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0924  hypothetical protein  25 
 
 
843 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  26.9 
 
 
276 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  35.58 
 
 
449 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  31.76 
 
 
876 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  31.76 
 
 
876 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  27.27 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.88 
 
 
294 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  21.93 
 
 
236 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  27.27 
 
 
254 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  26.05 
 
 
195 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  29.07 
 
 
222 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  28.36 
 
 
222 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  28.87 
 
 
191 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  27.03 
 
 
276 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>