105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0533 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  99.67 
 
 
303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  100 
 
 
303 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  62.84 
 
 
430 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  53.51 
 
 
302 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  49.34 
 
 
304 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  46.08 
 
 
309 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  47.35 
 
 
332 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  42.5 
 
 
327 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  39.43 
 
 
339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  38.96 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  37.8 
 
 
338 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  39.44 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  34.77 
 
 
344 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  31.56 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  30.28 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.53 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  30.54 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  31.13 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  27.37 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  32.2 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  31.08 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  32.84 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  33.16 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  28.09 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.17 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  30.6 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  26.84 
 
 
222 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  26.54 
 
 
203 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  26.9 
 
 
192 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  24.31 
 
 
197 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  27.36 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  25.31 
 
 
203 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  25.31 
 
 
197 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  35.77 
 
 
299 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  28.18 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  24.38 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  31.64 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  26.42 
 
 
211 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  29 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  26.77 
 
 
222 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  32.26 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  26.42 
 
 
216 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  31.19 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  23.2 
 
 
191 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  24.87 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25.93 
 
 
195 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  28.9 
 
 
454 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  23.24 
 
 
211 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  28.12 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  27.42 
 
 
191 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  28.45 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.16 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  28.64 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  25.5 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  30.81 
 
 
284 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  27.8 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.35 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  27.19 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  30.33 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  29.89 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  37.74 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  23.7 
 
 
249 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  27.03 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 
475 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
258 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  40.58 
 
 
1460 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  27.23 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  26.67 
 
 
263 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  35.04 
 
 
332 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  36.11 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 
457 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  34.26 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  30.83 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  47.92 
 
 
474 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  26.6 
 
 
524 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  35.19 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  29.31 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  27.18 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  37.25 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  37.25 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  37.25 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  35.19 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  34.19 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  25.6 
 
 
255 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  28.83 
 
 
200 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  26.5 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.23 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  28.83 
 
 
200 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2482  hypothetical protein  39.29 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
256 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
239 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  36.75 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  55.81 
 
 
487 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  53.49 
 
 
488 aa  42.7  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  29.19 
 
 
281 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 
772 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>