40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0301 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1005    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  95.7 
 
 		 487 aa  967    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  55.1 
 
 		 495 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  52.72 
 
 		 474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  37.01 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  37.62 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  36.27 
 
 		 399 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  35.78 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  35.06 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  33.49 
 
 		 449 aa  206  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  32.75 
 
 		 387 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  32.85 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  29.48 
 
 		 407 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  29.9 
 
 		 413 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  29.9 
 
 		 413 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  31.44 
 
 		 437 aa  133  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  27.58 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  28.98 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  30.55 
 
 		 304 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  27.18 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  27.18 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  32.38 
 
 		 299 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  38.46 
 
 		 203 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  31 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  38.46 
 
 		 203 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0873  PGAP1 family protein  32.5 
 
 		 1257 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.730318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  34.15 
 
 		 287 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  29.08 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  34.15 
 
 		 287 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  35.38 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  32 
 
 		 589 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  34.57 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  37.18 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04171  hypothetical protein  38.67 
 
 		 197 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0117581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  47.92 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  41.57 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  25.19 
 
 		 225 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  53.49 
 
 		 194 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  37.66 
 
 		 276 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  43.75 
 
 		 457 aa  43.5  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>