27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3594 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  100 
 
 		 449 aa  886    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  51.06 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  51.54 
 
 		 414 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  52.3 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  51.77 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  47.38 
 
 		 374 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  48.19 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  41.08 
 
 		 387 aa  272  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  33.33 
 
 		 487 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  33.49 
 
 		 488 aa  206  9e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  37.12 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  37.12 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  30.2 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  39.41 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  35.68 
 
 		 418 aa  186  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  32.16 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  31.63 
 
 		 495 aa  170  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  35.69 
 
 		 378 aa  143  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  31.04 
 
 		 304 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  29.13 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  35.58 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  30.93 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  34.38 
 
 		 361 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  33.58 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4872  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0644082  normal  0.0526328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  41.67 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 743 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>