33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3545 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  100 
 
 		 423 aa  853    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  52.16 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  52.75 
 
 		 399 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  50.87 
 
 		 414 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  51.11 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  47.77 
 
 		 374 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  45.19 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  43.64 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  37.62 
 
 		 488 aa  239  9e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  37.62 
 
 		 487 aa  236  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  34.36 
 
 		 474 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  34.37 
 
 		 495 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  32.68 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  32.68 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  33.58 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  37.72 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  33.25 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  36.71 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  33.21 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  26.25 
 
 		 533 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.147109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  26.61 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  26.18 
 
 		 547 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  30.08 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 277 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2153  hypothetical protein  25.93 
 
 		 533 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2003  hypothetical protein  25.93 
 
 		 533 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2184  hypothetical protein  26.54 
 
 		 533 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  25.62 
 
 		 533 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  26.54 
 
 		 533 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 292 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2300  hypothetical protein  26.54 
 
 		 533 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.140059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  31.16 
 
 		 284 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2158  hypothetical protein  25.62 
 
 		 533 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>