29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4373 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  100 
 
 
374 aa  759    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  51.19 
 
 
399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  50.4 
 
 
399 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  47.38 
 
 
449 aa  348  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  49.33 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  47.51 
 
 
423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  48.06 
 
 
396 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  43.14 
 
 
387 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  35.06 
 
 
488 aa  218  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  34.55 
 
 
487 aa  216  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  33.42 
 
 
474 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  37.42 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  37.42 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  37.06 
 
 
407 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  38.24 
 
 
418 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  36.5 
 
 
437 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  30.95 
 
 
495 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  33.75 
 
 
378 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  29.02 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  29.1 
 
 
382 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  36 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  32.88 
 
 
361 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  38.81 
 
 
197 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  33.87 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  40 
 
 
287 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  33.33 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  31.78 
 
 
284 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  29.57 
 
 
216 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2710  hypothetical protein  25.77 
 
 
292 aa  42.7  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000503547  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>