25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1023 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  91.14 
 
 		 414 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  100 
 
 		 399 aa  769    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  91.73 
 
 		 399 aa  694    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  51.06 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  52.62 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  54.14 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  50.4 
 
 		 374 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  40.66 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  35.66 
 
 		 474 aa  239  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  40.1 
 
 		 407 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  37.01 
 
 		 488 aa  230  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  35.8 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  39.16 
 
 		 413 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  39.16 
 
 		 413 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  35.47 
 
 		 495 aa  206  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  42.6 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  41.64 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  38.1 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  33.02 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  36.29 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  27.27 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  36.67 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  34.51 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  34.03 
 
 		 298 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  37.19 
 
 		 299 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>