27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2497 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  100 
 
 		 418 aa  825    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  49.05 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  41.5 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  41.55 
 
 		 413 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  41.55 
 
 		 413 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  41.85 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  38.26 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  35.68 
 
 		 449 aa  186  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  40.25 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  40.31 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  33.7 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  41.64 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  33.98 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  36.18 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  30.49 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  30.7 
 
 		 387 aa  126  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  27.58 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  27.58 
 
 		 487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  28.42 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  45.1 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  37.01 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  43.75 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.1 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0873  PGAP1 family protein  30.16 
 
 		 1257 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.730318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  28.93 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  31.4 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>