26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2070 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  100 
 
 
495 aa  1019    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  55.1 
 
 
488 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  54.66 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  45.82 
 
 
474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  35.47 
 
 
399 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  33.74 
 
 
423 aa  204  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  35.14 
 
 
414 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  35.06 
 
 
399 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  31.63 
 
 
449 aa  170  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  30.95 
 
 
374 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  29.68 
 
 
387 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  31.06 
 
 
396 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  33.73 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  31.6 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  30.25 
 
 
413 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  30.25 
 
 
413 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  28.42 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  29.49 
 
 
378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  31.31 
 
 
304 aa  100  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.22 
 
 
254 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.22 
 
 
254 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.28 
 
 
298 aa  47  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  28.92 
 
 
197 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  44 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  28.92 
 
 
203 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  37.97 
 
 
216 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>