88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1765 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  100 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  36.07 
 
 
334 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  34.36 
 
 
361 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  34.59 
 
 
282 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  34.18 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  38.66 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  34.02 
 
 
276 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  31.76 
 
 
294 aa  79  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.84 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  25.89 
 
 
254 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  31.61 
 
 
254 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  28.83 
 
 
216 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  27.46 
 
 
332 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  29.27 
 
 
302 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  27.73 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  28.93 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  29.11 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  29.91 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  30 
 
 
216 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  31.91 
 
 
240 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  35.04 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  29.11 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  30.23 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  35.65 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  30.85 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  30.81 
 
 
303 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.48 
 
 
430 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  27.42 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  26.94 
 
 
216 aa  49.7  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  33.66 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  26.15 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  34.51 
 
 
399 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  34.31 
 
 
378 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  34.34 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
268 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  23.98 
 
 
255 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  23.64 
 
 
393 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  27.43 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  31.19 
 
 
324 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1595  putative lipoprotein  30.33 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.146159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  26.53 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  34.34 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  33.05 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  29.08 
 
 
488 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  27.04 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0720  alpha/beta hydrolase fold protein  42.03 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.86668  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  42.86 
 
 
561 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  26.91 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  33.71 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  28.67 
 
 
487 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.18 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  27.04 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  33.58 
 
 
449 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1647  hypothetical protein  28.99 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.559763 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  35.4 
 
 
750 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  27.27 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  24.23 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2143  hydrolase/lipase  28.57 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  30.33 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  42.86 
 
 
876 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  30.43 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  34.62 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  42.86 
 
 
876 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  31.25 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  29.25 
 
 
209 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  31.78 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  31.16 
 
 
423 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  36.36 
 
 
259 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
364 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
259 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
259 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3348  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  30.53 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0147  hypothetical protein  29.07 
 
 
353 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 
592 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  29.52 
 
 
393 aa  42.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
317 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  28.65 
 
 
743 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  33.58 
 
 
437 aa  42  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>