25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2983 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  100 
 
 		 437 aa  838    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  49.53 
 
 		 418 aa  352  8.999999999999999e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  41.23 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  39.72 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  39.72 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  43.2 
 
 		 399 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  36.91 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  41.95 
 
 		 414 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  41.02 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  38.02 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  39.19 
 
 		 378 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  37.39 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  35.25 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  30.77 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  33.92 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  30.82 
 
 		 488 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  33.93 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  29.06 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  31.37 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  32.03 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1381 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  43.75 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  36.36 
 
 		 743 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  32.2 
 
 		 876 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  32.2 
 
 		 876 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>