30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4965 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  924    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  58.82 
 
 
459 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  30.3 
 
 
2159 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  28.96 
 
 
1937 aa  63.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  24.26 
 
 
1878 aa  60.1  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  26.36 
 
 
1460 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  22.09 
 
 
414 aa  56.6  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  31.02 
 
 
1805 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  28.47 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  32.37 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  32.37 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  37.23 
 
 
437 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  25.12 
 
 
876 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1868  hypothetical protein  30.69 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.602901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  25.12 
 
 
876 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  26.5 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  29.08 
 
 
1921 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  29.7 
 
 
312 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1972  hypothetical protein  35.16 
 
 
487 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  33.33 
 
 
449 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  24.43 
 
 
488 aa  47  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  37.18 
 
 
589 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  46 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  24.43 
 
 
487 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  32.34 
 
 
1831 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  23.72 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  39.66 
 
 
396 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  40 
 
 
407 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  43.75 
 
 
474 aa  43.5  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1595  putative lipoprotein  31.11 
 
 
336 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.146159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>