116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4204 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  100 
 
 
287 aa  567  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  95.47 
 
 
287 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  96.52 
 
 
287 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  70.98 
 
 
299 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  36.61 
 
 
342 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  27.36 
 
 
211 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  35.57 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  31.41 
 
 
194 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  34.62 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  31.61 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  35.54 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  32.9 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  30.4 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  31.31 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  36.94 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  36.14 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  34.81 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  29.94 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  37.6 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  29.95 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  30.15 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  31.58 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  29.67 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  36.69 
 
 
286 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  30.1 
 
 
289 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  33.18 
 
 
332 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  30.13 
 
 
192 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  27.5 
 
 
206 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  35.37 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  28.57 
 
 
222 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25.93 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25.93 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  32.98 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  37.17 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  24.05 
 
 
197 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  27.47 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  32.53 
 
 
361 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  26.85 
 
 
197 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  25.86 
 
 
203 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  29.65 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  26.85 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  33.6 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  27.81 
 
 
222 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.01 
 
 
225 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  26.24 
 
 
203 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  29.95 
 
 
294 aa  55.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  26.86 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  31.85 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  29.46 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  28.18 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  27.27 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  26.32 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  34.51 
 
 
302 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  24.19 
 
 
573 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  31.19 
 
 
303 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  25.49 
 
 
200 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  25.49 
 
 
200 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  35.45 
 
 
303 aa  48.9  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  35.19 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  32.41 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.18 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.86 
 
 
338 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  30.22 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
365 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  26.86 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  26.61 
 
 
364 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  28.86 
 
 
338 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  34.15 
 
 
488 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.69 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  30.41 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  35.96 
 
 
430 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  34.78 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  29.31 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  36.67 
 
 
533 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  30.84 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  38.1 
 
 
487 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  27.2 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  30.56 
 
 
547 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  25.81 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0134  PGAP1 family protein  30.9 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.535724  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3348  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  29.35 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  26.19 
 
 
367 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  27.19 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  51.16 
 
 
468 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  25.81 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  36.67 
 
 
533 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  26.19 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  26.19 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  26.19 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  24.19 
 
 
341 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  24.19 
 
 
360 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  24.19 
 
 
360 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  26.19 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  32.2 
 
 
405 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>